Основная цель анализирующего скрещивания — установить генотип особи, фенотипически проявляющей доминантный признак (определить, является ли ее генотип \( AA \) или \( Aa \)).
Особь, гомозиготная по рецессивному признаку (\( aa \)), необходима, потому что она производит только один тип гамет (\( a \)). Это позволяет однозначно определить, какие гаметы были произведены исследуемой особью, исходя из фенотипов ее потомства. Если исследуемая особь гетерозиготна (\( Aa \)), ее гамета \( a \) обязательно проявится в потомстве в сочетании с гаметой \( a \) особи-анализатора, что приведет к расщеплению \( 1:1 \) (\( Aa:aa \)).